La biblioteca Klementinum, un bello ejemplo de la arquitectura barroca, abrió sus puertas en 1722 como parte de la universidad jesuita y alberga más de 20,000 libros.
Los frescos del techo fueron pintados por Jan Hiebl. En 1781 el director Karel Rafael Ungar estableció la Biblioteca Nationalis, una colección de literatura en lengua checa.
Algunos de los libros históricos y raros de esta colección han sido enviados a Google para su digitalización y finalmente, estarán disponibles en Google Books.
Al igual que la biblioteca es un tesoro raro y poco conocido, también se la asocia con varios hechos poco conocidos: que el Klementinum era el tercer mayor colegio jesuita del mundo; que los registros meteorológicos locales comenzaron allí en 1775 y han continuado desde entonces; que aparece en una novela del famoso escritor Jorge Luis Borges.